Sumio Mondo est un chercheur. Son métier, trouver des objets, déchiffrer les mystères. Il est en permanence accompagné de sa valise Catherine, qui est en fait un super-ordinateur portable capable d'ouvrir tous les objets voire les consciences des personnes simplement en trouvant le code chiffré adéquat. Sumio reçoit une proposition de travail peu précise qu'il accepte. Il se rend donc sur l'île de Lospass Island, à l'hôtel Flower, Sun and Rain. Il y fait la connaissance du directeur de l'hôtel, Edo Macalister, l'homme qui requiert ses services. Il lui propose de passer la nuit à l'hôtel, et de tenter de stopper une attaque terroriste le lendemain : une bombe qui risque d'exploser à l'intérieur d'un avion de l'île.

Sorti uniquement au Japon en 2001 sur PlayStation 2, Flower, Sun and Rain avait accueille un portage réalisé par h.a.n.d. sur Nintendo DS en 2008 qui avait la particularité d'être traduit en français. Grasshopper Manufacture a annoncé lors du festival Hopper's Vol.5 au Japon qu'un remaster était également prévu.