Servi par des effets spéciaux en 3D très réussis, Fly Me to the Moon est cependant loin de la perfection. L'humour se veut assez convenu même parfois bien lourd (par exemple la mouche qui nous rote à la figure). Qui plus est, certaines scènes et personnages peuvent effrayer le jeune public. On pensera particulièrement à l'espion russe, qui est certes réussi, mais pas vraiment adapté à la cible. Le début du film n'est d'ailleurs pas vraiment joyeux, avec une longue scène montrant un singe enfermé dans une boîte pour être envoyé dans l'espace. L'aspect historique est peut être un minimum conservé, mais cela créé des lourdeurs. Par ailleurs, la qualité de l'animation laisse parfois à désirer, les personnages humains du film semblent se mouvoir toujours au ralenti, avec ce rythme caractéristique des images de synthèse qui donne un effet particulièrement artificiel.