Selon Famitsu, The Legend of Zelda : Twilight Princess HD proposera quelques différences depuis la mouture originale. Le nombre maximum de Rubis a été porté à 2000 (contre 1000 initialement), alors que la collecte des Larmes de Lumière ne demande plus que de ramasser 12 items (contre 16 auparavant).

Amazon annonce pour sa part qu'en utilisant un amiibo Zelda, vous pourrez même débloquer quelques bonus dans le jeu, comme recharger le carquois de flèches ou la jauge de cœur. Quant au nouvel amiibo Link Loup, il permettrait même d’accéder au donjon inédit « La Cave du Crépuscule ».