Pokémon Rubis et Saphir est un nouvel arc de trois tomes, issu de la série Pokémon Special (52 tomes à ce jour) publiée aux éditions Shogakukan.  Chaque arc narratif est en effet dédié à un épisode de la série créée sur Game Boy en 1995. Rubis, 11 ans, a grandi à Johto mais ses parents viennent de s'installer à Hoenn. Le jeune garçon déteste se battre et ne juge que par l'apparence de ses Pokémons. Ils préfèrent les rendre plus beaux que de faire des combats. Une situation qui déplait fortement à son père, lui même champion d'arène ! Rubis décide de fuguer et fait la rencontre de Saphir, une jeune fille de son âge, qui s'avère être la fille du professeur Seko, et surtout sa véritable opposée. Elle veut remporter tous les badges de la région d'Hoenn en 80 jours suite à un pari. Quant à Rubis, il se fixe comme objectif de réussir l'ensemble des concours Pokémon durant la même période. Malheureusement pour eux, ils sont interrompus par deux nouvelles organisations, la Team Magma qui veut étendre la terre et la Team Aqua qui veut étendre la mer.

Comme à l'accoutumée, Pokémon Rubis et Saphir propose de s'intéresser aux héros du jeu vidéo, qui vient récemment d'accueillir un remake sur Nintendo 3DS. En effet, on s'intéresse à l'odyssée de Rubis et Saphir, mais avec une variante cependant puisque la quête est ici divisée en deux (alors que le joueur doit tout faire pour sa part !). On passe ainsi fréquemment d'un personnage à l'autre, et à la fin des chapitres, on découvrir le temps restant pour accomplir la quête. Un carnet de voyages permettra d'ailleurs de mieux visionner l'avancée des protagonistes dans la région d'Hoenn. Le dessinateur n'est plus le même que dans Pokémon la grande aventure, mais la patte graphique demeure assez similaire néanmoins, avec un rendu des personnages un peu plus adulte cependant. Chaque tome de cette saga réunit en réalité deux volumes de l'édition japonaise,  et la publication quelques jours après l'édition de Rubis Oméga et Saphir Alpha permet de replonger idéalement dans cet univers de petits monstres.